Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms