Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC6Q96NY7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms