Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEN9

PDZD8, PDZ domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD8Q8NEN9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD8Q8NEN9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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