Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms