Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNE4Q8N205 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms