Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPARGC1BQ86YN6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PPARGC1BQ86YN6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPARGC1BQ86YN6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms