Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms