Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIK1Q3SY52 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIK1Q3SY52 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIK1Q3SY52 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIK1Q3SY52 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIK1Q3SY52 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIK1Q3SY52 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIK1Q3SY52 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIK1Q3SY52 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIK1Q3SY52 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIK1Q3SY52 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIK1Q3SY52 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIK1Q3SY52 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIK1Q3SY52 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIK1Q3SY52 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIK1Q3SY52 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIK1Q3SY52 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIK1Q3SY52 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIK1Q3SY52 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIK1Q3SY52 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIK1Q3SY52 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIK1Q3SY52 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIK1Q3SY52 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIK1Q3SY52 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIK1Q3SY52 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIK1Q3SY52 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIK1Q3SY52 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIK1Q3SY52 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIK1Q3SY52 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms