Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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KRTAP25-1Q3LHN0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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KRTAP25-1Q3LHN0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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KRTAP25-1Q3LHN0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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KRTAP25-1Q3LHN0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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KRTAP25-1Q3LHN0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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KRTAP25-1Q3LHN0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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KRTAP25-1Q3LHN0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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KRTAP25-1Q3LHN0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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KRTAP25-1Q3LHN0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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