Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA9Q16790 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA9Q16790 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA9Q16790 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA9Q16790 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA9Q16790 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA9Q16790 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA9Q16790 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CA9Q16790 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA9Q16790 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CA9Q16790 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA9Q16790 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA9Q16790 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA9Q16790 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA9Q16790 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA9Q16790 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA9Q16790 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA9Q16790 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA9Q16790 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA9Q16790 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA9Q16790 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA9Q16790 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA9Q16790 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA9Q16790 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA9Q16790 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CA9Q16790 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CA9Q16790 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CA9Q16790 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA9Q16790 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA9Q16790 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA9Q16790 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA9Q16790 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CA9Q16790 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA9Q16790 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA9Q16790 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA9Q16790 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA9Q16790 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA9Q16790 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA9Q16790 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA9Q16790 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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CA9Q16790 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA9Q16790 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CA9Q16790 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA9Q16790 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA9Q16790 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA9Q16790 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA9Q16790 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA9Q16790 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA9Q16790 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA9Q16790 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA9Q16790 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA9Q16790 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA9Q16790 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA9Q16790 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA9Q16790 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA9Q16790 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA9Q16790 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA9Q16790 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA9Q16790 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA9Q16790 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA9Q16790 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA9Q16790 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA9Q16790 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA9Q16790 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA9Q16790 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA9Q16790 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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