Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HIF1AQ16665 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
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