Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAF1CQ15572 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1CQ15572 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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