Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPNMBQ14956 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
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