Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB2Q13425 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTB2Q13425 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNTB2Q13425 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTB2Q13425 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTB2Q13425 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTB2Q13425 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms