Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SREBF2Q12772 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
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