Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE1Q08AE8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SPIRE1Q08AE8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 453.9 ms