Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERV-K104P61576 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms