Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS1P54277 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS1P54277 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS1P54277 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS1P54277 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS1P54277 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS1P54277 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS1P54277 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS1P54277 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS1P54277 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS1P54277 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS1P54277 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS1P54277 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS1P54277 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS1P54277 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS1P54277 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS1P54277 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS1P54277 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS1P54277 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS1P54277 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS1P54277 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS1P54277 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS1P54277 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS1P54277 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS1P54277 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS1P54277 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMS1P54277 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS1P54277 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS1P54277 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS1P54277 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS1P54277 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS1P54277 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS1P54277 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS1P54277 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS1P54277 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS1P54277 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS1P54277 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS1P54277 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS1P54277 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMS1P54277 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMS1P54277 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMS1P54277 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMS1P54277 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMS1P54277 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMS1P54277 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS1P54277 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS1P54277 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS1P54277 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS1P54277 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS1P54277 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS1P54277 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS1P54277 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS1P54277 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS1P54277 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS1P54277 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS1P54277 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS1P54277 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS1P54277 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS1P54277 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS1P54277 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS1P54277 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS1P54277 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS1P54277 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS1P54277 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS1P54277 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS1P54277 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS1P54277 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS1P54277 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS1P54277 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS1P54277 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS1P54277 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS1P54277 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS1P54277 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS1P54277 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS1P54277 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS1P54277 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS1P54277 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS1P54277 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS1P54277 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS1P54277 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS1P54277 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS1P54277 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS1P54277 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS1P54277 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS1P54277 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms