Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAGEA4P43358 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAGEA4P43358 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA4P43358 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA4P43358 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA4P43358 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms