Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	MED7	YOL135C	669 nt		3.61	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	DER1	YBR201W	636 nt		3.61	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	MTH1	YDR277C	1302 nt		3.61	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YDL032W	YDL032W	312 nt		3.6	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	MTC3	YGL226W	372 nt		3.6	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YKR075C	YKR075C	924 nt		3.6	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	CKS1	YBR135W	453 nt		3.6	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YRB30	YGL164C	1323 nt		3.6	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	FMP25	YLR077W	1752 nt		3.6	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	RRN6	YBL014C	2685 nt		3.6	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	AKR1	YDR264C	2295 nt		3.6	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YPR003C	YPR003C	2265 nt		3.6	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	MSN4	YKL062W	1893 nt		3.6	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	TED1	YIL039W	1422 nt		3.6	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	RPO31	YOR116C	4383 nt		3.6	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YPR022C	YPR022C	3402 nt		3.6	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	MSD1	YPL104W	1977 nt		3.6	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	URC2	YDR520C	2319 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	RTN1	YDR233C	888 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	HIM1	YDR317W	1245 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	MMS21	YEL019C	804 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	ECM34	YHL043W	513 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	VPS71	YML041C	843 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	HUT1	YPL244C	1020 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YDR098C-A	YDR098C-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YDR210C-C	YDR210C-C	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YDR261C-C	YDR261C-C	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YDR316W-A	YDR316W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YDR365W-A	YDR365W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YER137C-A	YER137C-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YER159C-A	YER159C-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YGR027W-A	YGR027W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YGR038C-A	YGR038C-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YGR161C-C	YGR161C-C	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YJR026W	YJR026W	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YJR028W	YJR028W	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YAR010C	YAR010C	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YLR157C-A	YLR157C-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YLR227W-A	YLR227W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YLR256W-A	YLR256W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YML040W	YML040W	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YML045W-A	YML045W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YMR051C	YMR051C	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YNL054W-A	YNL054W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YOL103W-A	YOL103W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YPL257W-A	YPL257W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YPR137C-A	YPR137C-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YPR158C-C	YPR158C-C	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	PUB1	YNL016W	1362 nt		3.59	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YGL140C	YGL140C	3660 nt		3.58	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	ASI1	YMR119W	1875 nt		3.58	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	HCA4	YJL033W	2313 nt		3.58	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	YDR193W	YDR193W	399 nt		3.58	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	SLX8	YER116C	825 nt		3.58	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	IRC25	YLR021W	540 nt		3.58	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	RIM11	YMR139W	1113 nt		3.58	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	CMK1	YFR014C	1341 nt		3.58	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	TAF1	YGR274C	3201 nt		3.57	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	RRP17	YDR412W	708 nt		3.57	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	RNR1	YER070W	2667 nt		3.57	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	MMM1	YLL006W	1281 nt		3.57	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	YLR152C	YLR152C	1731 nt		3.57	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	MAP1	YLR244C	1164 nt		3.57	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	RPL19B	YBL027W	570 nt		3.57	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	PLP2	YOR281C	861 nt		3.57	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	RAD17	YOR368W	1206 nt		3.57	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	RAD26	YJR035W	3258 nt		3.57	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	NUP133	YKR082W	3474 nt		3.56	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	MCP2	YLR253W	1710 nt		3.56	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	ARO9	YHR137W	1542 nt		3.56	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	FBP26	YJL155C	1359 nt		3.56	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	PHO92	YDR374C	921 nt		3.56	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	MRP13	YGR084C	1020 nt		3.56	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	SWC7	YLR385C	399 nt		3.56	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	MOH1	YBL049W	417 nt		3.56	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	HMT1	YBR034C	1047 nt		3.56	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	REG2	YBR050C	1017 nt		3.56	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	INA17	YPL099C	549 nt		3.56	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	TRK1	YJL129C	3708 nt		3.56	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	HPR1	YDR138W	2259 nt		3.56	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	PMT6	YGR199W	2280 nt		3.56	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	ABP140	YOR239W	1887 nt		3.56	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	NAM9	YNL137C	1461 nt		3.55	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	YKL071W	YKL071W	771 nt		3.55	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	SRN2	YLR119W	642 nt		3.55	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	IBD2	YNL164C	1056 nt		3.55	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	YBR137W	YBR137W	540 nt		3.55	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	YSH1	YLR277C	2340 nt		3.55	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	HCM1	YCR065W	1695 nt		3.55	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	RNY1	YPL123C	1305 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	BCK2	YER167W	2556 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	tC(GCA)B	tC(GCA)B	72 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	tC(GCA)G	tC(GCA)G	72 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	tC(GCA)P1	tC(GCA)P1	72 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	tC(GCA)P2	tC(GCA)P2	72 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	YDR526C	YDR526C	471 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	ECM4	YKR076W	1113 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	YBL077W	YBL077W	432 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	YOR073W-A	YOR073W-A	234 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	DSE3	YOR264W	1293 nt		3.54	□□□□□ -1.84

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