Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTHFD1P11586 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms