Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB6O95452 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB6O95452 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB6O95452 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB6O95452 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB6O95452 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB6O95452 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB6O95452 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB6O95452 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB6O95452 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB6O95452 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB6O95452 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB6O95452 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB6O95452 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB6O95452 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB6O95452 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB6O95452 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB6O95452 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB6O95452 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB6O95452 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB6O95452 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB6O95452 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB6O95452 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB6O95452 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB6O95452 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB6O95452 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB6O95452 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB6O95452 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB6O95452 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB6O95452 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB6O95452 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB6O95452 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB6O95452 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB6O95452 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB6O95452 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB6O95452 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB6O95452 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB6O95452 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB6O95452 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB6O95452 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB6O95452 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB6O95452 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB6O95452 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB6O95452 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB6O95452 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB6O95452 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB6O95452 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB6O95452 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB6O95452 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB6O95452 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms