Protein–RNA interactions for Protein: O94761

RECQL4, ATP-dependent DNA helicase Q4, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4O94761 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RECQL4O94761 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RECQL4O94761 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms