Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAD1O00515 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAD1O00515 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAD1O00515 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAD1O00515 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAD1O00515 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAD1O00515 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAD1O00515 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAD1O00515 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAD1O00515 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAD1O00515 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAD1O00515 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAD1O00515 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAD1O00515 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAD1O00515 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LAD1O00515 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAD1O00515 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LAD1O00515 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAD1O00515 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAD1O00515 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAD1O00515 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAD1O00515 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAD1O00515 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAD1O00515 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAD1O00515 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAD1O00515 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAD1O00515 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAD1O00515 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAD1O00515 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAD1O00515 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAD1O00515 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAD1O00515 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAD1O00515 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAD1O00515 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAD1O00515 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAD1O00515 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAD1O00515 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAD1O00515 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAD1O00515 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAD1O00515 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAD1O00515 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAD1O00515 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAD1O00515 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAD1O00515 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LAD1O00515 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAD1O00515 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAD1O00515 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LAD1O00515 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAD1O00515 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LAD1O00515 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LAD1O00515 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAD1O00515 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAD1O00515 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAD1O00515 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAD1O00515 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAD1O00515 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAD1O00515 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAD1O00515 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAD1O00515 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAD1O00515 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAD1O00515 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAD1O00515 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAD1O00515 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAD1O00515 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAD1O00515 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAD1O00515 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAD1O00515 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAD1O00515 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAD1O00515 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms