Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ARFGEF2Q9Y6D5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARFGEF2Q9Y6D5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARFGEF2Q9Y6D5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARFGEF2Q9Y6D5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARFGEF2Q9Y6D5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARFGEF2Q9Y6D5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms