Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms