Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF6Q9Y252 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms