Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms