Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREX1Q9NSU2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174 ms