Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms