Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3CQ99985 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms