Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD1Q96RS6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms