Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTD1Q8N815 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD1Q8N815 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms