Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 297.4 ms