Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms