Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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NEDD8Q15843 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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NEDD8Q15843 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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NEDD8Q15843 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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NEDD8Q15843 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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NEDD8Q15843 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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NEDD8Q15843 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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NEDD8Q15843 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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NEDD8Q15843 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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NEDD8Q15843 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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