Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
EEA1Q15075 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
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