Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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GPNMBQ14956 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPNMBQ14956 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
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