Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIGQ13278 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIGQ13278 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIGQ13278 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIGQ13278 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RIGQ13278 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIGQ13278 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIGQ13278 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIGQ13278 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIGQ13278 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIGQ13278 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIGQ13278 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIGQ13278 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIGQ13278 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIGQ13278 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIGQ13278 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIGQ13278 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIGQ13278 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIGQ13278 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIGQ13278 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIGQ13278 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIGQ13278 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIGQ13278 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIGQ13278 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIGQ13278 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIGQ13278 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIGQ13278 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIGQ13278 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIGQ13278 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIGQ13278 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIGQ13278 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIGQ13278 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIGQ13278 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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