Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF3Q13114 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF3Q13114 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF3Q13114 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF3Q13114 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF3Q13114 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF3Q13114 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF3Q13114 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF3Q13114 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF3Q13114 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF3Q13114 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF3Q13114 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF3Q13114 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF3Q13114 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF3Q13114 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF3Q13114 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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TRAF3Q13114 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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TRAF3Q13114 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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TRAF3Q13114 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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TRAF3Q13114 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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TRAF3Q13114 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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