Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms