Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1BQ01064 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms