Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms