Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RCAN1P53805 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms