Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG1BP48304 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
REG1BP48304 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
REG1BP48304 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
REG1BP48304 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
REG1BP48304 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
REG1BP48304 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
REG1BP48304 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
REG1BP48304 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
REG1BP48304 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
REG1BP48304 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
REG1BP48304 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
REG1BP48304 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
REG1BP48304 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
REG1BP48304 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
REG1BP48304 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
REG1BP48304 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
REG1BP48304 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
REG1BP48304 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
REG1BP48304 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
REG1BP48304 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
REG1BP48304 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
REG1BP48304 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
REG1BP48304 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REG1BP48304 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REG1BP48304 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REG1BP48304 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
REG1BP48304 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REG1BP48304 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REG1BP48304 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REG1BP48304 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REG1BP48304 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REG1BP48304 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REG1BP48304 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REG1BP48304 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REG1BP48304 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
REG1BP48304 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REG1BP48304 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REG1BP48304 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
REG1BP48304 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
REG1BP48304 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
REG1BP48304 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
REG1BP48304 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
REG1BP48304 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
REG1BP48304 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
REG1BP48304 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
REG1BP48304 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
REG1BP48304 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
REG1BP48304 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms