Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NF2P35240 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NF2P35240 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NF2P35240 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NF2P35240 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NF2P35240 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NF2P35240 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NF2P35240 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NF2P35240 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NF2P35240 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NF2P35240 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NF2P35240 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NF2P35240 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NF2P35240 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NF2P35240 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NF2P35240 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NF2P35240 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NF2P35240 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NF2P35240 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NF2P35240 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NF2P35240 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NF2P35240 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NF2P35240 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NF2P35240 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NF2P35240 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NF2P35240 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NF2P35240 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NF2P35240 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NF2P35240 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NF2P35240 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NF2P35240 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NF2P35240 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NF2P35240 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NF2P35240 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NF2P35240 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NF2P35240 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NF2P35240 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NF2P35240 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NF2P35240 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NF2P35240 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NF2P35240 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NF2P35240 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NF2P35240 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NF2P35240 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NF2P35240 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NF2P35240 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NF2P35240 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NF2P35240 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NF2P35240 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NF2P35240 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NF2P35240 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NF2P35240 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NF2P35240 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NF2P35240 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NF2P35240 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NF2P35240 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NF2P35240 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NF2P35240 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NF2P35240 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NF2P35240 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NF2P35240 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NF2P35240 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NF2P35240 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NF2P35240 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NF2P35240 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NF2P35240 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NF2P35240 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NF2P35240 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NF2P35240 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NF2P35240 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NF2P35240 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NF2P35240 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NF2P35240 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NF2P35240 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NF2P35240 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NF2P35240 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NF2P35240 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NF2P35240 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NF2P35240 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NF2P35240 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NF2P35240 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NF2P35240 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NF2P35240 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms