Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH5P33151 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH5P33151 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH5P33151 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH5P33151 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH5P33151 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH5P33151 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH5P33151 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH5P33151 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH5P33151 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH5P33151 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH5P33151 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH5P33151 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH5P33151 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH5P33151 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH5P33151 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH5P33151 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH5P33151 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH5P33151 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH5P33151 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH5P33151 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH5P33151 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH5P33151 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH5P33151 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH5P33151 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH5P33151 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH5P33151 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH5P33151 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH5P33151 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH5P33151 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH5P33151 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH5P33151 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH5P33151 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH5P33151 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH5P33151 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH5P33151 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH5P33151 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH5P33151 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH5P33151 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH5P33151 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH5P33151 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH5P33151 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH5P33151 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH5P33151 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH5P33151 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH5P33151 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH5P33151 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH5P33151 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH5P33151 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH5P33151 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH5P33151 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH5P33151 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH5P33151 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH5P33151 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH5P33151 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH5P33151 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH5P33151 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH5P33151 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH5P33151 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH5P33151 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH5P33151 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH5P33151 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH5P33151 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH5P33151 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH5P33151 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms