Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMP3P12645 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMP3P12645 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMP3P12645 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMP3P12645 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMP3P12645 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMP3P12645 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMP3P12645 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMP3P12645 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP3P12645 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMP3P12645 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMP3P12645 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMP3P12645 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMP3P12645 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMP3P12645 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMP3P12645 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMP3P12645 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMP3P12645 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BMP3P12645 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMP3P12645 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMP3P12645 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMP3P12645 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BMP3P12645 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BMP3P12645 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BMP3P12645 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BMP3P12645 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BMP3P12645 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BMP3P12645 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BMP3P12645 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BMP3P12645 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BMP3P12645 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BMP3P12645 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BMP3P12645 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BMP3P12645 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BMP3P12645 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BMP3P12645 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BMP3P12645 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BMP3P12645 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BMP3P12645 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BMP3P12645 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BMP3P12645 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BMP3P12645 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BMP3P12645 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BMP3P12645 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BMP3P12645 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BMP3P12645 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BMP3P12645 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BMP3P12645 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BMP3P12645 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BMP3P12645 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BMP3P12645 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BMP3P12645 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BMP3P12645 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BMP3P12645 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BMP3P12645 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP3P12645 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BMP3P12645 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BMP3P12645 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BMP3P12645 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BMP3P12645 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BMP3P12645 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BMP3P12645 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BMP3P12645 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BMP3P12645 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BMP3P12645 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BMP3P12645 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BMP3P12645 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BMP3P12645 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BMP3P12645 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BMP3P12645 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms