Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPO95166 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms