Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms